− 持明院統と大覚寺統の分立 − 
後嵯峨院が寛元年中（1243 - 1247）に崩御の折、遺勅で、
「一の御子後深草院が御即位されるように。退位の後は、長講堂領百八十か所を御領として、御子孫は在位の望みを持ってはいけない。次は二の御子亀山院が御即位されて、その子孫は累代断絶せず御治世を続けられるように。子細あって、このように命ずるのである」と、御遺命を残された。
これによって、後深草院が即位され、その御治世は宝治元年（1247）から正元元年（1259）に至るまでであった。次に亀山院の御子の後宇多院が建治元年（1275）から弘安十年（1287）に至るまで御在位された。
後嵯峨院の崩御の後、三代は御譲りに任せて御治世に問題はなかったが、後深草院の御子伏見院は、一の御子の御子孫なのに御即位されて、正応元年（1288）から永仁六年（1298）に至った。次に伏見院の御子持明院（後伏見天皇）が御即位されて、正安元年（1299）から同三年（1301）に至った。
この二代は関東のはからいで、邪（よこしま）な沙汰によるものであった。そのため、二の御子亀山院の御子孫に御鬱憤があったので、また理（ことわり）に任せて、後宇多院の御子、後二条院が御在位されて、乾元元年（1302）から徳治二年（1307）に至った。
この君に非義があったため、また立ち返って後伏見院の御弟萩原新院（花園天皇）が御在位され、延慶元年（1308）から文保二年（1318）に至った。
また御理運に帰す。後宇多院の二の御子後醍醐が御在位され、元応元年（1319）から元弘元年（1331）に至る。
このように、後嵯峨院の御遺勅に背いて御即位のことが転変し、また、関東が無道な沙汰におよんだので、「天命に背いた沙汰」と、思慮深い人々は耳目を驚かせた。
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